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Structural analysis of Spi-B DNA-binding Ets domain recognizing 5′-AGAA-3′ and 5′-GGAA-3′ sequences
https://kagawa-u.repo.nii.ac.jp/records/2000936
https://kagawa-u.repo.nii.ac.jp/records/20009369eb4745b-3a65-4fc1-84cd-cc2b1a44b778
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
BBRC749_151354
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| Item type | 学術雑誌論文 / Journal Article(1) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 公開日 | 2025-06-19 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| タイトル | Structural analysis of Spi-B DNA-binding Ets domain recognizing 5′-AGAA-3′ and 5′-GGAA-3′ sequences | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権 | restricted access | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_16ec | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者 |
野中, 康宏
× 野中, 康宏
× 星野, 克明
× 中村, 隆範
× 神鳥, 成弘
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| 抄録 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 内容記述 | Plasmacytoid dendritic cells produce large amounts of type-I interferon (IFN–I) upon sensing nucleic acid components of pathogens by Toll-like receptors (TLR7 and TLR9). The transcription factor Spi-B has the DNA-binding Ets domain, and transactivates the Ifna4 promoter co-operatively with IFN regulatory factor-7 (IRF-7) for TLR7/TLR9-induced IFN-I production. Spi-B associates with IRF-7, and activates transcription by binding to the 5′-AGAA-3′ sequence, being different from 5′-GGAA-3′, known as the Ets domain recognition sequence. To understand the molecular mechanism for the co-operative transactivation of the Ifna4 promoter by Spi-B and IRF-7, we performed X-ray structural determination of the Spi-B Ets domain in complex with target DNAs, including 5′-AGAA-3′ and 5′-GGAA-3′ sequences. Furthermore, we conducted a modeling study of the complex of the Spi-B and IRF-7 with Ifna4 promoter DNA. X-ray structures showed that the binding of the Spi-B Ets domain induces a kink in DNA at the recognition sequence, and a more kinked DNA structure was observed in 5′-AGAA-3′ than 5′-GGAA-3’. A modeling study showed that the Spi-B-induced kinked DNA structure in 5′-AGAA-3′ is favorable for Spi-B and IRF-7 to approach each other for association on DNA. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 書誌情報 |
en : Biochemical and Biophysical Research Communications 巻 749, 発行日 2025-04 |
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| 出版者 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版者 | Elsevier | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ISSN | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | EISSN | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 収録物識別子 | 1090-2104 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 権利情報 | © 2025 Elsevier Inc. All rights are reserved, including those for text and data mining, AI training, and similar technologies. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 助成情報 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | Crossref Funder | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子タイプURI | https://www.crossref.org/services/funder-registry/ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 助成機関識別子 | https://doi.org/10.13039/100015075 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | 香川大学 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 助成機関名 | Kagawa University | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubMed番号 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連タイプ | isReferencedBy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子タイプ | PMID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 関連識別子 | 39892964 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Plasmacytoid dendritic cells | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Spi-B | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Type I interferon | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | Type I interferon regulatory factor-7 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 主題 | X-ray structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
