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アイテム
環境DNAを用いたニッポンバラタナゴの生息確認
https://kagawa-u.repo.nii.ac.jp/records/7199
https://kagawa-u.repo.nii.ac.jp/records/719941fabcd3-46f3-457d-bcfe-a9d3854a1f3a
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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AN00038339_071_L027 (274.6 kB)
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| Item type | 紀要論文 / Departmental Bulletin Paper(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2021-03-22 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | 環境DNAを用いたニッポンバラタナゴの生息確認 | |||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | Detection of the presence of Japanese rosy bitterling using environmental DNA | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | eng | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||||||
| 資源タイプ | departmental bulletin paper | |||||||||||
| アクセス権 | ||||||||||||
| アクセス権 | open access | |||||||||||
| アクセス権URI | http://purl.org/coar/access_right/c_abf2 | |||||||||||
| 著者 |
池田, 滋
× 池田, 滋
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| 抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||
| 内容記述 | ニッポンバラタナゴは絶滅に瀕している日本固有の淡水魚である。東讃地方はその貴重な生息地の1つである。ニッポンバラタナゴ東讃集団の生息状況は，魚体DNAを用いたミトコンドリアDNAのPCR-RFLPマーカーやマイクロサテライトマーカーを分析することでモニターされている。環境DNA利用により魚体サンプリングコストの軽減を図るため，ニッポンバラタナゴが生息する11ヶ所のため池，生息しない1ヶ所のため池，および最近まで生息していたビオトープから得られた環境DNA中のCyt-Bおよび18S rRNA遺伝子の断片をPCR増幅することでニッポンバラタナゴの生息確認が可能かどうか実証した。2段階ネスティドPCRにより，ニッポンバラタナゴが生息する11ヶ所のため池すべてと，最近まで生息していたビオトープの環境DNAから，ニッポンバラタナゴの18S rRNA遺伝子の81 bp断片を，生息しないため池から擬陽性断片を検出することなく，検出することができた。 | |||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Abstract | |||||||||||
| 内容記述 | Japanese rosy bitterling is a critically endangered freshwater fish in Japan. The eastern Kagawa is one of its rare habitats. The eastern Kagawa population of Japanese rosy bitterling has been genetically monitored with individual DNA-based analysis using mitochondrial PCR-RFLP and microsatellite markers. Environmental DNA analysis can allow to reduce the cost of sampling specimens. This study was performed to demonstrate the feasibility of monitoring Japanese rosy bitterling using environmental DNA. Cyt-B and 18S rRNA genes were targeted for PCR amplification. The detection of the presence of the Japanese rosy bitterling in all eleven farm ponds, where the fish inhabit, was possible using the two-step nested PCR of the 81 bp fragment in 18S rRNA gene from the environmental DNA extracted from only one water sample per farm pond. Moreover, any target fragment, which demonstrates the false presence of the Japanese rosy bitterling, from the two genes was not detected in a farm pond which is not inhabited by the fish. | |||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 書誌情報 |
ja : 香川大学農学部学術報告 en : Technical bulletin of Faculty of Agriculture, Kagawa University 巻 71, 号 124, p. 27-32, 発行日 2019-02-28 |
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| 出版者 | ||||||||||||
| 出版者 | 香川大学農学部 | |||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| ISSN | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | PISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 0368-5128 | |||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AN00038339 | |||||||||||
| 論文ID（NAID） | ||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||
| 識別子タイプ | NAID | |||||||||||
| 関連識別子 | 40021836977 | |||||||||||
| 関連サイト | ||||||||||||
| 関連タイプ | isIdenticalTo | |||||||||||
| 識別子タイプ | URI | |||||||||||
| 関連識別子 | https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010926818 | |||||||||||
| 著者版フラグ | ||||||||||||
| 出版タイプ | VoR | |||||||||||
| 出版タイプResource | http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | ニッポンバラタナゴ | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 生息 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 池 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 環境DNA | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 生息確認 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 11ヶ所 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | ビオトープ | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | rRNA遺伝子 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | 検出 | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | PCR | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | Japanese rosy bitterling | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | two-step nested PCR | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 言語 | en | |||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | environmental DNA | |||||||||||
